silnice na České Budějovice v blízkosti Budějovické brány byla v letech 1895 - 1898 vystavěna nová školní budova, určená pro obecnou školu chlapeckou, neboť prostory v Hradecké bráně, které sloužily ke vzdělávání, již nevyhovovaly. Dívky v té době navštěvovaly školu soukromou nebo klášterní. V roce 1927 byla dívčí škola sloučena se školou obecnou. Od roku 1949 se zde učili žáci od první do páté třídy v takzvané Národní škole. Když v roce 1953 byla změněna školní docházka na osmiletou, navštěvovaly školu děti od 6 do 14 let.
alší školou, která v Třeboni zajišťovala vzdělání, bylo gymnázium, založené již v roce 1868. V letech 1905 - 1906 získalo i gymnázium novou budovu, vystavěnou na západní straně Komenského sadů.
ěsto se postupně rozrůstalo, zvyšoval se počet obyvatel, přibývalo dětí. Školství procházelo četnými reformami. Škola obecná a měšťanská byla nahrazena základní školou osmiletou, později devítiletou. Také gymnázium zaznamenalo změny. Vznikla jedenáctiletá a dvanáctiletá střední škola, pak střední všeobecně vzdělávací škola, později opět gymnázium.
důsledku všech změn se třeboňské školství již v padesátých letech potýkalo s problémem, kam umístit narůstající počet tříd. Některé třídy základní devítileté školy a školní družina byly přestěhovány do zámku. Šlo o řešení dočasné, neboť v nevyhovujících prostorách zámeckých budov nebylo možné vyučovat trvale.